Oltre ai settori direttamente destinati al pubblico, l'Archivio assicura anche altre attività istituzionali:
- Le Commissioni di sorveglianza sugli archivi degli uffici dello Stato, che costituiscono un'attività specificamente rivolta agli archivi correnti dell'amministrazione dello Stato.
- il Servizio conservazione cura la predisposizione, l'affidamento e l'esecuzione da parte di laboratori esterni dei progetti di restauro conservativo di materiale archivistico danneggiato. Concorrono alla conservazione, ma come attività svolta all'interno dell'Istituto, in seno alla Sezione di fotoriproduzione, i due laboratori rispettivamente di legatoria e restauro.
- ordinamento e inventariazione: si svolge in seno all'Istituto l'attività di schedatura, inventariazione e ordinamento dei fondi archivistici, ad opera dei funzionari e del personale interno, di professionisti esterni, oppure in forma di tesi di laurea specialistica o come specifici progetti.
Negli ultimi due anni è stato rilevante l'apporto di studenti dell'Università Cà Foscari - Venezia che hanno svolto periodi di tirocinio all'interno dell'Istituto, e dei volontari dell'
Archeoclub di Venezia.
I risultati delle attività svolte vengono mano a mano messi a disposizione della sala di studio, ed è allo studio la modalità di pubblicarli integrandoli alla banca dati del patrimonio documentario.
I servizi complessivi dell'Istituto sono descritti nell'organigramma presente in questo sito